QIWI лучше всего использовать если пополняешь на разные сайты в интернете, лучше хранить там относительно небольшие суммы(до 50 000). WebMoney удобен тем, что бы хранить другие валюты кроме рубля(например Доллары и Евро), еще он удобен что бы пополнять на более крупные суммы(например в казино). Как по мне Яндекс-деньги вообще ничем не отличается от QIWI, не вижу смысла его существования.